สาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ เป็นสาขาวิชาแรกของคณะวิทยาศาสตร์ที่เริ่มจัดตั้งมาพร้อมกับคณะวิทยาศาสตร์ โดยมีประวัติความเป็นมาดังนี้
ปีการศึกษา 2538 ภาควิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ได้เปิดสอนหลักสูตรสาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ขึ้น เป็นสาขาวิชาแรกในคณะวิทยาศาสตร์ โดยมีนักศึกษาเข้าศึกษาเป็นรุ่นแรกจำนวน 38 คน พร้อมกับได้รับงบประมาณจัดซื้อเครื่องไมโครคอมพิวเตอร์คอมพิวเตอร์รุ่น486 เพิ่มอีกจำนวน 30 เครื่อง ต่อจากนั้นในแต่ละปีการศึกษาก็รับนักศึกษาเข้าใหม่อีกปีละประมาณ 50 คน ปีการศึกษา 2547 ภาควิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ ได้เพิ่มจำนวนห้องเรียนปฏิบัติการคอมพิวเตอร์ จำนวน 1 ห้องเรียน และห้องบรรยายคอมพิวเตอร์จำนวน 1 ห้องเรียน สำหรับใช้ในการเรียนการสอนของสาขาวิชาเทคโนโลยีสารสนเทศ โดยตั้งอยู่ที่อาคารเรียนรวมทางวิทยาศาสตร์ (หลังเก่า) 2 ชั้น ปีการศึกษา 2551 ภาควิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ ยกเลิกภาควิชาเปลี่ยนแปลงเป็น สาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ แยกตัวออกจากสาขาวิชาเทคโนโลยีสารสนเทศ